Lord Voldemort y sus acólitos ganan poder y fuerza causando caos y dolor tanto en el mundo mágico como en el muggle. La Orden del Fénix está debilitada, bajo ataque, y sufriendo graves pérdidas.
Mientras Harry empieza su sexto año en la escuela, las medidas de seguridad de Hogwarts aumentan. Harry se ve a sí mismo y a todos a su alrededor de un modo diferente. Los rumores de que él es "el elegido" para enfrentarse a Voldemort crecen, y Albus Dumbledore comienza a darle a Harry clases particulares en las que le revela muchos secretos sorprendentes acerca del malvado lord, a quien Harry debe estudiar para llegar a conocer su única debilidad.
Un libro mágico y poderoso de pociones y hechizos que perteneció a un misterioso príncipe llega a manos de Harry, trayendo ayuda y un nuevo misterio.
Una novia, una gran traición, y la muerte de una de las personas que más quiere cambian el modo en que Harry ve el mundo a su alrededor y lo llevan a tomar la decisión de no volver a Hogwarts hasta no haber derrotado a Voldemort.